مدلسازی جریان آب و انتقال آلودگی در محدوده معدن نقش اساسی و غیرقابل‌انکار دارد چون فرایندهای فیزیکی، شیمیایی و زیستی در زیرسطح و روی سطح زمین با هم درهم‌آمیخته‌اند و رفتار آلاینده‌ها در فضا و زمان بسیار پیچیده است. اندازه‌گیری میدانی به‌تنهایی هرگز نمی‌تواند همه‌جا و در همه زمان‌ها حضور داشته باشد؛ مدل‌های ریاضی و شبیه‌سازی به ما امکان می‌دهند ساختار میدان جریان، مسیرهای اصلی جابجایی و نواحی تجمع آلاینده را پیش‌بینی کنیم تا شناخت عمیق‌تری از فرایندهای پنهان به‌دست آید.